Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms