Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms