Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms