Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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