Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms