Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms