Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms