Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms