Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms