Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms