Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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