Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms