Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms