Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms