Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COG7P83436 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COG7P83436 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms