Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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