Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2FP61218 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms