Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms