Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OXCT1P55809 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms