Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms