Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23BP54727 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms