Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms