Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms