Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX1P48742 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms