Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms