Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms