Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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