Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms