Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms