Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCKBRP32239 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms