Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms