Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms