Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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