Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms