Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB3P16520 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB3P16520 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GNB3P16520 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms