Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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