Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms