Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms