Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3B2A6NCE7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms