Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms