Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms