Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms