Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms