Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGAP28Q9P2N2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms