Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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