Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms