Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms