Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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