Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms