Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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